Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms