Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms