Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gapvd1Q6PAR5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms