Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep135Q6P5D4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cep135Q6P5D4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep135Q6P5D4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms