Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms