Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms