Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop58Q6DFW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms