Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms