Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms