Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms