Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Rbm38Q62176 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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