Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms