Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin1Q60865 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin1Q60865 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms