Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stxbp3Q60770 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stxbp3Q60770 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms