Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms