Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms