Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms