Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5BN45 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5BN45 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5BN45 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5BN45 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms