Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms