Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms