Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc114Q3UX62 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc114Q3UX62 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms