Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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