Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms