Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll12Q3UDE2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms