Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms