Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms