Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms