Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1aQ2LKU9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1aQ2LKU9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms