Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms