Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms