Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Caprin2Q05A80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Caprin2Q05A80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms