Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top1Q04750 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms