Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax5Q02650 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms