Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp39Q02525 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp39Q02525 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms