Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mc1rQ01727 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms