Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms