Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn1bP97952 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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