Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2cP97760 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2cP97760 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms