Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms