Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms