Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhobP62746 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhobP62746 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhobP62746 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhobP62746 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms