Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Depdc5P61460 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Depdc5P61460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms