Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf3P61205 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms