Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Paxbp1P58501 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms