Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms