Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cav1P49817 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cav1P49817 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms