Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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