Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLCP48506 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLCP48506 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLCP48506 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLCP48506 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCLCP48506 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCLCP48506 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms