Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppm1bP36993 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppm1bP36993 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms