Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms